TENDUA

Classification des espèces : traditionnelle ou phylogénétique ?

Myriam Dupuis — 2011-12-19T20:54:11Z

La classification classique ou traditionnelle se base sur les ressemblances les plus évidentes entre espèces. Elle a été mise en place longtemps avant que l'idée d'évolution ne s'impose.
Ainsi, en utilisant les caractères les plus visibles, la classification classique ne permet pas d'estimer correctement les degrés de parenté entre espèces, et ce n'était pas son objectif d'origine. Elle est toutefois utile aux reconnaissances d'espèces par des clés de détermination, ou pour la gestion de collections biologiques. Elle est facilement utilisable par le grand public. Selon cette classification, un poisson sera toujours plus proche d'un autre poisson que d'une autre espèce non poisson.
Cela n'est en fait pas toujours vrai. En effet, les caractéristiques immédiates d'un poisson sont ses nageoires et ses écailles. Or l'un des caractères des humains est la présence de membre charnu et non rayonné. Et ce caractère est commun avec un poisson très connu : le cœlacanthe. Mais il n'est pas présent chez la truite par exemple. Un cœlacanthe est-il plus proche d'un humain ou d'une truite ? Faut-il utiliser pour établir la parenté la plus étroite, le membre charnu ou la présence de nageoires ?

Dans les années 1950, la classification phylogénétique voit le jour. C'est un système de classification des êtres vivants dont l'objectif est de rendre compte des degrés de parenté entre les espèces. Cela permet donc de comprendre leur histoire évolutive (ou phylogénie). Elle ne reconnaît pas certains groupes comme les reptiles ou les poissons contrairement à la classification classique.
La classification phylogénétique a remplacé la classification traditionnelle dans la plupart des milieux scientifiques et dans l'enseignement secondaire en France.

CITES

Fabrice Borgese — 2011-11-02T23:17:31Z

La Convention sur le commerce international des espèces de faune et de flore sauvages menacées d'extinction, dite CITES ou « Convention de Washington », est un accord passé entre Etats afin de veiller à ce que le commerce international des espèces animales et végétales inscrites dans ses annexes, ne nuise pas à la conservation de la biodiversité. Les Etats signataires (appelés « Parties ») sont actuellement au nombre de 169.
En vigueur depuis 1975, cette Convention réglemente le passage aux frontières de plus de 33000 espèces. Elle s'applique aux animaux et aux végétaux vivants ou morts, de même que les parties, produits et objets qui en sont dérivés (appelés aussi spécimens).

Selon le degré de protection dont elles ont besoin, les 5000 espèces animales et les 28000 espèces végétales couvertes par la CITES figurent sur trois annexes différentes :

L'Annexe I

comprend toutes les espèces menacées d'extinction. Le commerce de leurs spécimens n'est autorisé que dans des conditions exceptionnelles (recherche scientifique par exemple).

L'Annexe II

comprend toutes les espèces qui ne sont pas nécessairement menacées d'extinction mais dont le commerce des spécimens doit être réglementé pour éviter une exploitation incompatible avec leur survie.

L'Annexe III

comprend toutes les espèces déjà protégées dans un pays, et qui a demandé aux autres Parties leur assistance pour en contrôler le commerce.

Les importations, exportations ou réexportations de spécimens inscrits à ces annexes sont soumises à la présentation en douane de permis spécifiques. Les autorités nationales ne les délivrent que si elles ont la certitude que ces spécimens ont été obtenus légalement et que leur prélèvement ne nuit pas au bon état de conservation des espèces dont ils sont issus.

La « liste rouge » de l'UICN

Fabrice Borgese, Myriam Dupuis — 2011-11-02T22:37:09Z

Fondée en 1948 par les Nations Unies, l'Union Internationale pour la Conservation de la Nature et de ses Ressources (dénommée aussi Comité Mondial pour la Nature ou UICN) est un organisme international qui pilote de nombreuses activités en faveur de la sauvegarde du milieu naturel. Il regroupe, au sein d'un partenariat original quelques 82 états, 111 établissements publics et 800 organisations non gouvernementales. Il anime également un réseau d'environ 10 000 scientifiques et experts regroupés au sein de commissions spécialisées et de groupes de travail thématiques.

L'une de ses principales missions consiste à établir et mettre à jour une « liste rouge » des espèces animales et végétales dont la pérennité est menacée. Un ensemble de critères rigoureux et reconnus permet d'évaluer le risque d'extinction de ces espèces et de les classer dans l'une des neuf catégories que compte cet inventaire. De façon simplifiée, un taxon est classé :

©M. Dupuis - Mérou rouge ou vieille étoilée classé Données Insuffisantes

Cephalopolis miniata - Données Insuffisantes

M. Dupuis

ÉTEINT(EX)

Lorsqu'il ne fait aucun doute que le dernier individu soit mort.

ÉTEINT A LA VIE SAUVAGE (EW)

Lorsqu'il ne survit qu'en culture, en captivité ou dans le cadre d'une population (ou de populations), nettement en dehors de son ancienne aire de répartition.

EN DANGER CRITIQUE D'EXTINCTION (CR)

Lorsqu'il est confronté à un risque extrêmement élevé d'extinction à l'état sauvage.

EN DANGER (EN)

Lorsqu'il est confronté à un risque très élevé d'extinction à l'état sauvage.

©M. Dupuis - Guépard classé vulnérable

Acinonyx jubatus - Vulnérable

M. Dupuis

VULNÉRABLE (VU)

Lorsqu'il est confronté à un risque élevé d'extinction à l'état sauvage.

QUASI MENACÉ (NT)

Lorsqu'il n'entre dans aucune des catégories nommées ci-dessus mais qu'il pourra remplir les critères pour y rentrer dans un avenir proche.

PRÉOCCUPATION MINEURE (LC)

Une espèce est dite de Préoccupation mineure lorsqu'elle a été évaluée d'après les critères et ne remplit pas les critères des catégories En danger critique d'extinction, En danger ou Vulnérable ou Quasi menacé. Dans cette catégorie sont incluses les espèces largement répandues et abondantes. L'Humain fait partie de cette catégorie.

©M. Dupuis - Faon de cerf tacheté classé Préoccupation Mineure

Axis axis - Préoccupation Mineure

M. Dupuis

DONNÉES INSUFFISANTES (DD)

Lorsqu'on ne dispose pas d'assez de données pour évaluer le risque d'extinction de sa population.

NON ÉVALUÉ (NE)

Lorsqu'il n'a pas encore été confronté aux critères permettant d'évaluer son statut.

Petit Glossaire de la Biodiversité

Fabrice Borgese — 2011-10-09T22:38:44Z

Allochtone

Se dit d'une espèce originaire d'une autre région géographique.

Anthropique

Se dit d'un milieu ou d'un site modifié par l'activité humaine.

Autochtone

Se dit d'une espèce originaire de la région où elle vit.

Biodiversité

Terme désignant la richesse biologique d'un écosystème, d'une région, d'un pays.

Biogéographie

Distribution des espèces animales et végétales sur notre planète et évolution de cette distribution.

Biomasse

Quantité de matière vivante correspondant à une surface ou à un volume donné. Le poids total de tous les individus d'une même espèce donne la biomasse de cette espèce.

Biotope

Ensemble stable composé par les éléments tels que les minéraux, les éléments climatiques, chimiques et physiques) d'un écosystème, et qui possède les ressources nécessaires à la vie d'une communauté d'animaux et de végétaux (la biocénose). Terme souvent utilisé de façon large et abusive pour désigner l'habitat d'une espèce (végétation, édifice corallien…).

Canopée

Partie sommitale du feuillage des arbres. Strate la plus haute d'une forêt.

Conservation

Lorsque l'on parle de conservation de la nature ou de la biodiversité, il s'agit des actions mises en place visant à protéger des espèces animales et végétales et à conserver l'intégrité écologique des habitats naturels ou de substitution façonnés par l'homme. La conservation de la nature n'est pas une science en soi, mais se définit par l'action à condition que cette dernière s'appuie sur la science.

Commensalisme

Relation inter-spécifique entre une espèce A et une espèce B. Exploitation non-parasitaire d'une espèce vivante par une autre espèce. Le commensalisme est une variante du parasitisme ; si l'hôte fournit une partie de sa propre nourriture au commensal, il n'obtient en revanche aucune contrepartie évidente de ce dernier (la relation est à bénéfice non-réciproque). Le commensalisme est une association non-destructrice pour l'hôte (ce qui le différencie du parasitisme) ; ce dernier peut tout à fait continuer à vivre et évoluer en présence du commensal et, le plus souvent, « ignore » tout de la relation. Les survies des deux organismes interdépendants.

Écosystème

Ensemble des éléments qui constituent le milieu (le biotope : sol, air, eau) et des organismes vivants (biocénose) qui l'habitent et de leurs influences mutuelles.

Endémique

Se dit d'une espèce native d'une région déterminée ( pays, région, archipel, île, vallée…) et que l'on ne rencontre nulle part ailleurs en site naturel.

Frondaison

Ensemble des branches et feuilles d'un arbre ou par extension d'un bois, d'une forêt.

Indigène

Se dit d'une espèce naturellement présente sur une aire géographique, avant la colonisation de l'homme.

Introduite

Se dit d'une espèce qui n'est pas historiquement présente sur une aire géographique et dont la présence est le fruit d'une intervention humaine.

Juvénile

Jeune individu d'un espèce qui n'est pas encore en mesure de se reproduire.

Marron(ne)

Se dit d'un animal domestique redevenu sauvage. Se dit également de certaines plantes (noms vernaculaires).

Opportuniste

Qualifie un comportement souple qui s'adapte aux ressources accessibles sur le moment (alimentation, site de nidification…).

Ovipare

Se dit d'un animal qui se reproduit en pondant des œufs.

Ovovivipare

Se dit d'un animal qui met au monde des petits vivants après avoir incubé des œufs dans ses voies génitales.

Parasitisme

Relation inter-spécifique entre une espèce A et une espèce B ; relation biologique symbiotique dont l'un (le parasite) tire profit (en se nourrissant, en s'abritant ou en se reproduisant) aux dépens de son hôte .

Pélagique

Relatif à la pleine mer. Se dit d'un animal marin (oiseau, poisson, mammifère) qui vit en haute mer une grande partie de l'année, éloigné du fond et de tout substrat.

Réhabilitation

Restauration d'un site ou d'un milieu, visant à rétablir si possible l'écosystème présent antérieurement ou un environnement proche ou à plus forte naturalité, avant que l'action directe ou indirecte de l'homme ne l'ait détérioré.

Réintroduction

La réintroduction d'espèces animales ou végétales dans leur milieu naturel est une des stratégies mises en œuvre par la biologie de la conservation. C'est une notion administrative, écologiquement relative. On la trouve dans les plans de gestion globaux. La réintroduction tente de reconstituer une population viable d'une espèce localement disparue (où dont la population s'est effondrée) à partir du moment où la ou les causes de sa disparition antérieure a/ont été identifiées et maitrisées. On parle également de renforcement des populations.

Service écosystémique

Il s'agit de l'ensemble des biens et services rendus par la nature (eau, air, nourriture,climat, couverture végétale,...) et nécessaires à la survie, au bien-être et au développement de l'humanité. La notion de service écosystémique renvoie à la valeur, monétaire ou autre, des écosystèmes. Ces services, et donc la survie de l'humanité, dépendent de la biodiversité sur Terre

Sous-espèce

Population d'une espèce donnée présentant des caractères morphologiques particuliers qui les distinguent d'autres populations de cette espèce. La sous-espèce suit l'espèce, elle est la dernière catégorie de la nomenclature binominale.

Spéciation

Phénomène d'évolution qui touche une population isolée et conduit à la formation d'une espèce nouvelle.

Strate

En botanique, ensemble de végétaux qui se trouvent à une même hauteur au-dessus du sol.

Subadulte

Animal proche du stade adulte mais qui montre encore certains signes d'immaturité physique ou sociale.

Substrat

Support géologique. En milieu marin, les substrats durs sont constitués le plus souvent de roche ou de madréporaires fixes. La vase et le sable sont des substrats dits « meubles ».

Symbiose

Relation inter-spécifique entre une espèce A et une espèce B. Association intime et durable entre deux organismes d'espèces différentes. Les organismes sont qualifiés de symbiotes ; le plus gros peut être qualifié d'hôte.

Taxon

Unité de la Systématique permettant la classification des espèces. Les principaux taxons sont : la classe, l'ordre, la famille, le genre, l'espèce, la sous-espèce.

Taxonomie

Science des lois de la classification des êtres vivants, incluant leur identification et leur rangement dans la nomenclature binominale.

Territoire

Aire géographique défendue par un individu, un couple ou un groupe afin de conserver notamment la ressource alimentaire.

Trophique

Relatif à l'alimentation (chaîne trophique, réseau trophique, niveau trophique…)

Vernaculaire

Se dit du nom commun attribué à une espèce ou à un groupe d'espèces dans une langue régionale.

Vivipare

Se dit d'un animal qui met au monde des petits vivants après gestation (développement des embryons dans le corps maternel).

Zoonose

Maladie infectieuse qui peut être transmise à l'homme par les animaux, et réciproquement.